Details for gene set CELL_CYCLE

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	CELL_CYCLE_PROCESS
Enrichment Score (ES)	0.15457264
Normalized Enrichment Score (NES)	2.485991
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.004436701
FWER p-Value	0.06

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	EPGN	300	1.205	-0.0110	Yes
2	DMC1	813	0.614	-0.0336	Yes
3	CCNA1	1027	0.505	-0.0399	Yes
4	CETN1	1055	0.498	-0.0361	Yes
5	BUB1B	1065	0.494	-0.0314	Yes
6	BUB1	1092	0.485	-0.0275	Yes
7	ANLN	1230	0.430	-0.0297	Yes
8	MYO16	1342	0.390	-0.0305	Yes
9	CENPE	1389	0.375	-0.0278	Yes
10	MYH10	1393	0.374	-0.0227	Yes
11	CD28	1505	0.348	-0.0235	Yes
12	KRT7	1525	0.346	-0.0193	Yes
13	TUBE1	1655	0.318	-0.0210	Yes
14	MAD2L1	1890	0.278	-0.0285	Yes
15	PRC1	1928	0.270	-0.0253	Yes
16	NDC80	1929	0.270	-0.0200	Yes
17	KIF23	2046	0.256	-0.0211	Yes
18	SMC4	2048	0.256	-0.0159	Yes
19	NEK2	2116	0.249	-0.0143	Yes
20	CIT	2256	0.233	-0.0166	Yes
21	STMN1	2284	0.230	-0.0128	Yes
22	NCAPH	2343	0.224	-0.0107	Yes
23	KIF2C	2487	0.210	-0.0133	Yes
24	LATS2	2671	0.196	-0.0179	Yes
25	TAF1	2718	0.192	-0.0152	Yes
26	RAD51	2804	0.185	-0.0146	Yes
27	RAD21	2827	0.183	-0.0105	Yes
28	ATM	2839	0.183	-0.0059	Yes
29	TTN	3008	0.172	-0.0098	Yes
30	PAM	3056	0.169	-0.0071	Yes
31	CDKN3	3065	0.169	-0.0023	Yes
32	RAD54L	3193	0.160	-0.0039	Yes
33	LATS1	3271	0.156	-0.0029	Yes
34	CDKN2A	3352	0.153	-0.0020	Yes
35	NDE1	3401	0.150	0.0007	Yes
36	TUBG1	3605	0.140	-0.0051	Yes
37	CENPF	3767	0.133	-0.0086	Yes
38	KIF15	3786	0.131	-0.0044	Yes
39	BCAT1	3791	0.131	0.0007	Yes
40	DLGAP5	3800	0.131	0.0055	Yes
41	KPNA2	3854	0.128	0.0078	Yes
42	POLA1	3973	0.124	0.0067	Yes
43	PBRM1	3975	0.123	0.0118	Yes
44	CKAP5	4056	0.120	0.0127	Yes
45	KIF11	4120	0.118	0.0146	Yes
46	SMC1A	4150	0.117	0.0182	Yes
47	CCP110	4430	0.107	0.0083	Yes
48	APBB2	4506	0.104	0.0095	Yes
49	CDKN1B	4648	0.099	0.0071	Yes
50	KNTC1	4855	0.093	0.0012	Yes
51	TGFA	4908	0.091	0.0036	Yes
52	FOXN3	4933	0.090	0.0075	Yes
53	MDM4	4948	0.090	0.0120	Yes
54	HSPA2	4997	0.089	0.0146	Yes
55	XRCC2	5063	0.087	0.0163	Yes
56	RAD50	5089	0.086	0.0202	Yes
57	SPDYA	5113	0.086	0.0242	Yes
58	RAD54B	5135	0.085	0.0283	Yes
59	SUN2	5150	0.085	0.0328	Yes
60	RB1	5209	0.083	0.0349	Yes
61	BRCA2	5211	0.083	0.0400	Yes
62	MRE11A	5577	0.073	0.0255	Yes
63	LIG3	5593	0.073	0.0299	Yes
64	CDKN1C	5627	0.072	0.0333	Yes
65	MSH4	5956	0.063	0.0208	Yes
66	PDS5B	5957	0.063	0.0260	Yes
67	PAPD7	5967	0.063	0.0308	Yes
68	MPHOSPH9	6050	0.061	0.0316	Yes
69	PAFAH1B1	6070	0.061	0.0358	Yes
70	PPP6C	6118	0.060	0.0385	Yes
71	CETN3	6335	0.054	0.0320	Yes
72	PIM2	6341	0.054	0.0369	Yes
73	RAD17	6346	0.054	0.0420	Yes
74	CUL1	6347	0.054	0.0472	Yes
75	CUL5	6418	0.052	0.0486	Yes
76	CCNA2	6441	0.052	0.0527	Yes
77	NPM1	6508	0.050	0.0543	Yes
78	SMC3	6713	0.046	0.0485	Yes
79	KHDRBS1	6737	0.045	0.0525	Yes
80	NUMA1	6738	0.045	0.0577	Yes
81	PKMYT1	6754	0.045	0.0622	Yes
82	PPP5C	6807	0.044	0.0646	Yes
83	CDK13	6878	0.042	0.0660	Yes
84	CDCA5	6937	0.041	0.0681	Yes
85	CUL4A	6965	0.040	0.0719	Yes
86	INHBA	7006	0.039	0.0749	Yes
87	POLE	7013	0.039	0.0798	Yes
88	NUSAP1	7047	0.038	0.0833	Yes
89	DBF4	7213	0.035	0.0796	Yes
90	TGFB1	7321	0.033	0.0790	Yes
91	CLIP1	7373	0.032	0.0815	Yes
92	CUL3	7686	0.025	0.0698	Yes
93	CDK4	7720	0.025	0.0732	Yes
94	CEP250	7788	0.023	0.0748	Yes
95	TARDBP	8033	0.019	0.0669	Yes
96	ZWINT	8125	0.017	0.0672	Yes
97	TPX2	8186	0.016	0.0691	Yes
98	ANAPC5	8246	0.014	0.0712	Yes
99	MSH5	8258	0.014	0.0758	Yes
100	ARAP1	8315	0.013	0.0780	Yes
101	ACVR1	8320	0.013	0.0830	Yes
102	ACVR1B	8356	0.012	0.0864	Yes
103	RAD1	8370	0.012	0.0909	Yes
104	ABL1	8493	0.009	0.0895	Yes
105	CNTROB	8568	0.008	0.0907	Yes
106	DCTN3	8586	0.007	0.0950	Yes
107	E2F1	8624	0.006	0.0983	Yes
108	KATNA1	8647	0.006	0.1023	Yes
109	RINT1	8765	0.004	0.1012	Yes
110	ANAPC10	8773	0.004	0.1061	Yes
111	SKP2	8899	0.001	0.1045	Yes
112	RAD51B	8953	0.000	0.1069	Yes
113	REC8	8996	-0.001	0.1098	Yes
114	PLK1	9017	-0.001	0.1140	Yes
115	NOLC1	9079	-0.003	0.1159	Yes
116	FBXO5	9110	-0.003	0.1195	Yes
117	PRMT5	9209	-0.005	0.1195	Yes
118	AURKA	9230	-0.006	0.1236	Yes
119	NBN	9337	-0.008	0.1231	Yes
120	RAN	9514	-0.011	0.1188	Yes
121	CUL2	9562	-0.012	0.1215	Yes
122	GSPT1	9570	-0.012	0.1263	Yes
123	CDK6	9572	-0.012	0.1315	Yes
124	PML	9601	-0.013	0.1352	Yes
125	ANAPC4	9604	-0.013	0.1404	Yes
126	CDC16	9651	-0.014	0.1431	Yes
127	SSSCA1	9877	-0.018	0.1361	Yes
128	RAD51D	9895	-0.019	0.1404	Yes
129	SUGT1	9932	-0.019	0.1437	Yes
130	CDC25C	9962	-0.020	0.1474	Yes
131	DCTN2	10042	-0.021	0.1483	Yes
132	KIF22	10201	-0.024	0.1450	Yes
133	PIN1	10462	-0.029	0.1361	Yes
134	CDK2AP1	10537	-0.031	0.1374	Yes
135	CHMP1A	10575	-0.031	0.1406	Yes
136	AKAP8	10632	-0.033	0.1428	Yes
137	SASS6	10698	-0.034	0.1445	Yes
138	RAD52	10747	-0.035	0.1471	Yes
139	ANAPC11	10787	-0.036	0.1503	Yes
140	CDC27	10947	-0.040	0.1469	Yes
141	TPD52L1	10967	-0.041	0.1511	Yes
142	CDK2	11000	-0.041	0.1546	Yes
143	PCBP4	11405	-0.051	0.1379	No
144	CHEK1	11554	-0.054	0.1351	No
145	CDK10	11623	-0.056	0.1367	No
146	TIPIN	11806	-0.060	0.1320	No
147	CDC25B	12002	-0.065	0.1267	No
148	PRUNE2	12162	-0.069	0.1233	No
149	TIMELESS	12360	-0.074	0.1178	No
150	TOP3A	12393	-0.074	0.1213	No
151	CHFR	12403	-0.074	0.1261	No
152	RACGAP1	12496	-0.077	0.1263	No
153	FOXO4	12585	-0.080	0.1268	No
154	ZW10	12681	-0.083	0.1269	No
155	TTK	12686	-0.083	0.1319	No
156	CDC23	12726	-0.084	0.1350	No
157	STAG3	12746	-0.085	0.1392	No
158	NEK6	12894	-0.089	0.1365	No
159	ESPL1	13077	-0.094	0.1319	No
160	GFI1	13254	-0.100	0.1276	No
161	PTPRC	13364	-0.104	0.1269	No
162	MAP3K11	13393	-0.105	0.1306	No
163	EGF	13596	-0.111	0.1249	No
164	TBRG4	13931	-0.125	0.1120	No
165	APBB1	14191	-0.138	0.1032	No
166	BIRC5	14208	-0.139	0.1076	No
167	POLD1	14247	-0.141	0.1107	No
168	CDKN2C	14522	-0.154	0.1011	No
169	SAC3D1	14577	-0.157	0.1034	No
170	CDKN2D	14651	-0.161	0.1047	No
171	UBE2C	14685	-0.163	0.1081	No
172	CDC6	14834	-0.174	0.1054	No
173	BRSK1	14836	-0.174	0.1105	No
174	CDKN2B	14900	-0.178	0.1124	No
175	MAD2L2	15047	-0.189	0.1097	No
176	DUSP13	15050	-0.189	0.1148	No
177	TRIAP1	15716	-0.251	0.0840	No
178	MPHOSPH6	15811	-0.264	0.0841	No
179	LEPREL4	15820	-0.265	0.0889	No
180	CDC7	15989	-0.286	0.0850	No
181	CDKN1A	16184	-0.313	0.0797	No
182	NPM2	16235	-0.324	0.0823	No
183	RCC1	16333	-0.339	0.0822	No
184	KIF25	16740	-0.435	0.0655	No
185	DDX11	17173	-0.568	0.0473	No
186	GFI1B	17405	-0.681	0.0400	No
187	EREG	17447	-0.702	0.0430	No
188	USH1C	17763	-0.935	0.0311	No
189	BOLL	17843	-0.990	0.0321	No
190	GML	17955	-1.090	0.0313	No
191	SYCP1	18415	-2.067	0.0117	No